Целью деятельности Архангельского НИИ сельского хозяйства является научное обеспечение развития АПК на обширной территории Архангельской области и Ненецкого автономного округа.
Выполнение данной цели осуществляется при объединении усилий структурных подразделений института.
Исследования выполняются согласно «Государственному заданию на оказание государственных услуг (работ) и выполнение государственных работ» и Программе фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2013-2020 гг., а также по госконтрактам с Министерством АПК и торговли Архангельской области и грантам федеральных и региональных фондов. Кроме того, институт проводит большой объем научно-исследовательских и внедренческих работ по хоздоговорам с сельскохозяйственными предприятиями и другими организациями области и округа.
Для решения основных вопросов планирования и проведения научных работ созданы Ученый совет и методические комиссии по отраслям исследований.