Инновационной деятельности в работе института отводится значительное место. Она построена на постоянной связи лабораторий и отделов института с предприятиями опытной сети, где законченные научно-технические разработки проходят производственную проверку. Ежегодно для внедрения в производство институт передает региональному Министерству АПК и торговли каталог научно-технической продукции. Отработанные в производственных условиях научные разработки через сайт института и регионального отраслевого министерства рекомендуются к внедрению в хозяйствах.
На базе опытных хозяйств института ежегодно проводятся научно-практические семинары со специалистами АПК, где демонстрируются результаты научной и инновационной деятельности института.